OpenAI正在嘗試通過AI再造蛋白質(zhì),其GPT-4b micro大模型有望應(yīng)用于再生醫(yī)學(xué),業(yè)內(nèi)寄希望于這種技術(shù)可以將人類壽命延長10年。
去年,當(dāng)諾貝爾化學(xué)獎花落AlphaFold時,用AI改革生物醫(yī)學(xué)的風(fēng)潮就已經(jīng)燃起,如今,有越來越多的公司正在入局。
OpenAI與Retro Biosciences聯(lián)合研究的新模型名為GPT-4b micro,這是GPT-4o大模型的定制版本,專為Retro構(gòu)建,專注于生物工程。
Retro Biosciences是一家總部位于舊金山的長壽研究公司,致力于將人類壽命延長10年,為此,他們研究了Yamanaka因子,這組蛋白質(zhì)是一種讓成熟細胞恢復(fù)活力的干細胞,被認為是構(gòu)建人體器官或者替代受損細胞的可能方案。
但這種細胞再造工程的效率并不高,實驗室結(jié)果表明,細胞的逆生長概率只有1%。
為此,OpenAI與Retro合作推出了GPT-4b micro大模型,經(jīng)過訓(xùn)練,可以提供重新設(shè)計蛋白質(zhì)的方法。
與AlphaFold預(yù)測蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)不同,GPT-4b micro更注重蛋白質(zhì)之間的相互作用,輔助設(shè)計新蛋白質(zhì)。這意味著,GPT-4b micro不僅預(yù)測了特定的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),還通過靶向修改這些蛋白質(zhì),以獲得所需的結(jié)果,該模型為創(chuàng)造更有效的再生療法提供了可能。
OpenAI研究人員表示,GPT-4b micro將Yamanaka因子的有效性提高了50倍以上。
在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的實際應(yīng)用方面,通過高效生產(chǎn)多種細胞,GPT-4b micro為創(chuàng)造功能性器官和替換受損細胞提供了可能,從而解決器官移植中的嚴重短缺問題,并為各種退行性疾病提供創(chuàng)新治療方法。
比如,科學(xué)家們可以借助這種方法,為患者定制移植器官,降低排異反應(yīng)風(fēng)險并提高移植成功率。細胞替代療法則有望用于治療目前控制效果有限的疾病,比如帕金森病、糖尿病等。
除了一次性應(yīng)用之外,這項技術(shù)還可以為大規(guī)模組織工程提供新策略,促進因年齡、疾病或受傷而受損的整個器官再生,或這些器官內(nèi)特定關(guān)鍵組織的再生,從而加快再生醫(yī)學(xué)的研究步伐。
不過,截至目前,該項目尚未確定發(fā)布時間表。外部科學(xué)家在結(jié)果發(fā)布之前,無法判斷結(jié)果是否真實,該模型的效力,也只局限于目前公布的案例,未經(jīng)廣泛使用驗證過。
生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域?qū)W者,也在擔(dān)憂AI與生物整合研究帶來的社會倫理影響,比如能夠負擔(dān)得起延長壽命技術(shù)的人和負擔(dān)不起的人之間,存在迫在眉睫的“生物鴻溝”。
AI與生物醫(yī)學(xué)的關(guān)聯(lián),有了前所未有的突破,OpenAI的加入,也像是一種風(fēng)向標。
早在2023年,OpenAI首席執(zhí)行官山姆·奧特曼(Sam Altman)就以個人投資的名義向Retro Biosciences注入了1.8億美元。
如今,OpenAI與Retro在業(yè)務(wù)層面的合作,有望為后者吸引來大量的關(guān)注度和資金量。
國內(nèi)方面,也有多家公司正在積極布局以AI輔助提升生物醫(yī)藥研發(fā)工作。
賽瑞思利用新一代AI技術(shù)進行創(chuàng)新藥開發(fā),自主研發(fā)的AI蛋白質(zhì)大模型也致力于對蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的預(yù)測,產(chǎn)品性能與AlphaFold2比肩,可以縮短制藥研發(fā)時間、提升成藥概率。
百奧幾何由AI藥物發(fā)現(xiàn)科學(xué)家唐建于2022年創(chuàng)立,研發(fā)的生成式AI抗體設(shè)計大模型 Geoflow,能夠同時用于抗原-抗體復(fù)合物結(jié)構(gòu)預(yù)測和抗體從頭設(shè)計,在抗原-抗體復(fù)合物結(jié)構(gòu)預(yù)測任務(wù)上,其top-1成功率達到43.9%,與AlphaFold3持平。
天鶩科技由上海交大洪亮團隊創(chuàng)建于2021年,是目前國內(nèi)最大的AI蛋白質(zhì)設(shè)計服務(wù)商。開發(fā)了基于預(yù)訓(xùn)練的蛋白質(zhì)設(shè)計通用人工智能 AccelProtein?,采用Transformer架構(gòu)和掩碼語言模型,通過在近十億條覆蓋各種環(huán)境下生物體蛋白質(zhì)序列的復(fù)雜數(shù)據(jù)上進行訓(xùn)練,實現(xiàn)了從“序列到功能”的映射,具備零樣本預(yù)測能力,可以將蛋白質(zhì)性質(zhì)的優(yōu)化時長從傳統(tǒng)的2-5年縮短至2-6個月。
泓博醫(yī)藥將人工智能算法與藥物設(shè)計相結(jié)合,以提高藥物研發(fā)效率,主要應(yīng)用于大規(guī)模虛擬篩選、SBDD、FBDD、LBDD 以及藥物代謝性質(zhì)的預(yù)測等方面。
睿智醫(yī)藥已將AlphaFold等AI技術(shù)應(yīng)用于藥物設(shè)計、抗體工程等藥物研發(fā)業(yè)務(wù)中。
沙利文大中華區(qū)執(zhí)行總監(jiān)周明子此前曾向21世紀經(jīng)濟報道記者表示:“我國科研界需加強對相關(guān)技術(shù)的學(xué)習(xí)和應(yīng)用,促進跨學(xué)科合作,特別是在人工智能與生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的融合。”
“同時,企業(yè)應(yīng)加大前沿生物技術(shù)的投入,構(gòu)建強大的技術(shù)研發(fā)能力與國際合作網(wǎng)絡(luò),以把握未來的市場機遇。”周明子表示。